Programma MD-PhD della Scuola di Medicina

Trascrittomica e genomica funzionale applicate alla diagnosi e terapia delle patologie neoplastiche. Responsabile prof Enzo Medico

Sommario insegnamento

• Programma
• Attività di supporto
• Note
• Strumenti didattici
• Scheda del corso

Programma

Il progetto prevede un approccio genomico-funzionale e computazionale allo studio delle patologie neoplastiche, che verrà attuato mediante tre linee di ricerca strettamente integrate:

1) Analisi trascrittomica dell'espressione di mRNA e microRNA, mediante DNA microarray e deep-sequencing, in campioni di tessuto tumorale (carcinoma colorettale, mammario, prostatico e altri) e in modelli sperimentali cellulari e animali, allo scopo di evidenziare gruppi di geni (signatures) la cui espressione sia correlata alla propensione metastatica della malattia e/o alla responsività a specifici trattamenti terapeutici (terapie mirate e chemioterapie, terapia ormonale del ca. Mammario, radioterapia del ca rettale).
2) Screening funzionali su modelli cellulari, volti all'identificazione di geni la cui inattivazione o iperattivazione induca modifiche funzionali alle cellule studiate, quali l'acquisizione o soppressione di motilità e/o invasività, la resistenza o responsività a trattamenti farmacologici, l'incremento o riduzione della proliferazione o dell'apoptosi. Questo consentirà di evidenziare nuovi bersagli terapeutici e marcatori diagnostici per il management clinico della patologia neoplastica.
3) Integrazione dei dati sperimentali trascrittomici e funzionali, e loro ulteriore integrazione mediante data-mining su banche di dati pubblici di espressione, mutazione e annotazione funzionale, per la definizione delle reti (networks) che governano l'espressione e l'attività dei geni di interesse e delle loro alterazioni nelle patologie neoplastiche studiate.

Attività di supporto

Collaboratori: Raffaele Calogero, Michele Caselle, Michele De Bortoli

Note

• Progetto del corso: Fenotipizzazione molecolare dei tumori per la diagnosi e la terapia
• Qualificazione scientifica del coordinatore: Pubblicazioni del prof. Medico su PubMed 
• Struttura in cui si svolge attività di ricerca: Laboratorio di Oncogenomica c/o IRCC di Candiolo, attrezzato per analisi trascrittomiche con DNA microarray, PCR e sequenziamento, biologia molecolare e cellulare, analisi bioinformatiche. Centro interdipartimentale "SysBioM",
  laboratori di biologia computazionale c/o: Dip. Fisica Teorica e Dip. Biologia Animale e dell'Uomo a Torino, Dip. Scienze Cliniche e Biologiche a Orbassano.

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